Hernán Alvarez fue un defensa peruano que se desempeñaba como back derecho y jugó en Sport Boys durante 9 temporadas. Era hermano de Andrés Alvarez y primo de Arturo Paredes.
Estuvo en Sport Boys desde 1937 donde debutó como insider tras la lesión de su hermano Andrés. En ese partido Boys logró el título de Primera División. En los siguientes años fue half para luego consolidarse como back derecho.
En 1942 fue titular en el equipo que consiguió el campeonato de ese año. Luego sufrió una lesión en una vértebra lumbar que lo alejó de las canchas hasta 1945 que fue su último año con la rosada.